Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMRK1Q9NWW6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms