Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF358Q9NW07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF358Q9NW07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF358Q9NW07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF358Q9NW07 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF358Q9NW07 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms