Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIC8BQ9NVN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIC8BQ9NVN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms