Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM30AQ9NV96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM30AQ9NV96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM30AQ9NV96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM30AQ9NV96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM30AQ9NV96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms