Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF13Q9NV06 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCAF13Q9NV06 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCAF13Q9NV06 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms