Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCF3Q9NUQ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms