Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACER3Q9NUN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACER3Q9NUN7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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