Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC3Q9NUD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms