Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG3Q9NT62 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG3Q9NT62 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG3Q9NT62 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms