Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOMER3Q9NSC5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOMER3Q9NSC5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOMER3Q9NSC5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms