Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHPT1Q9NRX4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHPT1Q9NRX4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms