Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMPRSS4Q9NRS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms