Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
DUOX2Q9NRD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DUOX2Q9NRD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DUOX2Q9NRD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms