Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR9Q9NR96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR9Q9NR96 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR9Q9NR96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms