Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF3Q9NR23 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF3Q9NR23 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF3Q9NR23 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms