Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS2Q9NR19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS2Q9NR19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms