Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRTAC1Q9NQ79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAC1Q9NQ79 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms