Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGO4Q9HCK5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGO4Q9HCK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGO4Q9HCK5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms