Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR55Q9H6Y2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR55Q9H6Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR55Q9H6Y2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms