Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4AQ9H3S1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4AQ9H3S1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4AQ9H3S1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms