Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R1Q9GZP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R1Q9GZP7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms