Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YIPF3Q9GZM5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF3Q9GZM5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms