Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE41Q9C0J9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BHLHE41Q9C0J9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms