Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBE2OQ9C0C9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2OQ9C0C9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms