Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXQ1Q9C009 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXQ1Q9C009 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms