Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms