Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RNF17Q9BXT8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RNF17Q9BXT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms