Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms