Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRT1Q9BWW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCRT1Q9BWW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms