Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM43Q9BTV4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM43Q9BTV4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms