Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBGCP2Q9BSJ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms