Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RIOK1Q9BRS2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RIOK1Q9BRS2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIOK1Q9BRS2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms