Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms