Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPIN3Q9BQK8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPIN3Q9BQK8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms