Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPGQ9BPX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAPGQ9BPX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPGQ9BPX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms