Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL3Q99963 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL3Q99963 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms