Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF12Q99081 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms