Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC6Q96SB8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC6Q96SB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms