Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WRNIP1Q96S55 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
WRNIP1Q96S55 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms