Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KC1Q96S38 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KC1Q96S38 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KC1Q96S38 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms