Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A9Q96Q91 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A9Q96Q91 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms