Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP4Q96PP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP4Q96PP9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms