Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHAMP1Q96JM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAMP1Q96JM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAMP1Q96JM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms