Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VCPIP1Q96JH7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VCPIP1Q96JH7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms