Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CRELD1Q96HD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRELD1Q96HD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms