Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM11Q96F44 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM11Q96F44 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms