Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF18Q96CE8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF18Q96CE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM4SF18Q96CE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms