Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD2Q96C19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFHD2Q96C19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFHD2Q96C19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms