Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG2BQ96BY7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG2BQ96BY7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG2BQ96BY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms