Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms